Le mariage homosexuel n'était pas encore autorisé en Californie que déjà John Travolta se voyait épouser l'homme de sa vie. Un projet freiné par l'Eglise de Scientologie, dont il est adepte. En effet, ce mouvement créé par Ron Hubbard l'homosexualité comme une " perversion sexuelle " et promet une guérison à ceux qui en sont " atteints "

  John n'a de cesse que de démentir les rumeurs sur sa présumée homosexualité. De manière systématique, l'acteur traine ses supposés amants un peu trop bavards devant les tribunaux, par exemple Doug Gotterba son ancien pilote. Il y a trois ans, un masseur d'un spa gay l'avait même accusé d'agression sexuelle dans son livre " You'll never spa in this town again " et demandait 2 millions de dollars de dommages. La star, absent aux moments des faits qui lui étaient reprochés, a été blanchie.

Malgré tout,son mariage avec Kelly Preston est souvent décrit comme une mascarade et les témoignages continuent d'affluer dans ce sens. Le livre " Devenir Clair " ( Ed. Piranha), qui sortira le 13 octobre en France affirme une nouvelle fois que la star de La Fièvre du Samedi soir a toujours préféré les hommes aux femmes. Un ouvrage dans lequel on apprend également que Tom Cruise n'a pas réussi à recruter Steven Spielberg au sein de l'Eglise de Scientologie.

Dans cette minutieuse enquête sur cette association considérée en France comme une secte, l'auteur, Lawrence Wright a récolté le témoignage de Jesse Prince. Cet ancien haut responsable de la religion créée par Ron Hubbard affirme :

"John Travolta menaçait d'épouser un homme, même si cela n'était pas encore permis par la loi". Ainsi nombreux étaient ceux à connaître les véritables penchants de l'acteur, et cela permettait à l'Eglise d'avoir un moyen de pression sur leur célèbre adepte. Inquiet d'ailleurs que son secret ne soit révélé, John a voulu s'assurer auprès de Bill Franks, à l'époque direction exécutif, si ses confessions privées lors de ses auditions scientologues resteraient secrètes. Ce à quoi le responsable a répondu : " oui bien entendu ". Un gros mensonge car les agents du renseignement de l'Eglise avaient déjà reçu l'ordre de réunir des informations à utiliser contre l'acteur en cas de besoin. Le voilà obligé de chanter les louanges de l'Eglise de Scientologie de l'Eglise..."